国家安全保障会議が設立されてから数年で、大統領は彼ら自身の意思決定のスタイルに合うようにそれを再編成しました。リンドン・ジョンソン大統領は、国務長官、CIA長官、統合参謀本部議長を集めた定期的な火曜日の昼食会を設定しました。リチャード・ニクソン大統領の下で、NSCは再び拡大し、国家安全保障補佐官ヘンリー・キッシンジャーの部門から分析を収集することに焦点を合わせました。多くの点で、国家安全保障顧問は、外交政策の決定について相談さえされなかったウィリアム・ロジャース国務長官よりも重要になりました。
ジェラルド・フォード大統領はニクソンのシステムをほぼ維持しましたが、ジミー・カーター大統領の下で、国家安全保障顧問は舞台裏のマネージャーではなく、大統領のアイデアの公のスポークスマンになりました。
ロナルド・レーガン大統領の下で、NSCは諮問グループから、外交および国家安全保障政策を支援するために実際に秘密の作戦を実行する組織に変身しました。レーガンの後継者であるジョージHWブッシュは、NSCの元の機能に戻りました。彼は、行政機関全体で合意に達し、政策を調整することを目標とした委員会でいっぱいのフローチャートを作成しました。次の3人の大統領（ビル・クリントン、ジョージ・W・ブッシュ、バラク・オバマ）がブッシュの上級者のアプローチに固執するほどスムーズに機能しました[出典：Whittaker、etal。 ]。
しかし、オバマ政権によって、NSCは約400人のスタッフに膨れ上がり、クリントン政権の4倍の規模になりました。それらの半分は、さまざまな部門や機関から貸し出されていました[出典：DeYoung ]。膨大な数の人々が、数か月、時には数年に及ぶ繰り返しの会議で、意思決定の難しさについて内部の苦情を引き起こしました。
ドナルド・トランプ大統領は2017年1月に就任し、ワシントンで物事を揺るがすことを約束しました。これにはNSCも含まれていました。就任から約一週間後、議会を抜本的に再編成する覚書を発行した。トランプは、ホワイトハウスの政治戦略家スティーブ・バノン（彼の物議を醸す極右の見解で知られる人物）をNSCの本格的なメンバーにしました。
同時に、彼は統合参謀本部議長と国家情報長官、NSCに法律で含まれている2人の職員を、通常NSCの会議に出席する人々のリストから除外し、代わりに「出席する」と宣言した。 [のみ]彼らの責任と専門知識に関連する問題が議論される場所」[出典：Jaffe、ホワイトハウス]。
この最後の点についてマスコミで騒動があったが、それは誇張されたと言う人もいる。前大統領の下では、統合参謀本部議長と国家情報長官は、議論されている問題が彼らに関係がない場合、会議をスキップすることがあった[出典：Qiu ]。
